Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nbr1P97432 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nbr1P97432 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nbr1P97432 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms