Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SmsP97355 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SmsP97355 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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SmsP97355 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SmsP97355 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SmsP97355 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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