Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RhodP97348 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RhodP97348 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RhodP97348 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RhodP97348 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RhodP97348 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RhodP97348 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms