Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-3P97334 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms