Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3f3aP84244 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms