Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx1P80205 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx1P80205 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx1P80205 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx1P80205 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx1P80205 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx1P80205 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otx1P80205 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms