Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1bP70700 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms