Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufd1P70362 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufd1P70362 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufd1P70362 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufd1P70362 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ufd1P70362 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufd1P70362 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufd1P70362 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufd1P70362 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufd1P70362 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufd1P70362 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms