Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Casp4P70343 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casp4P70343 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp4P70343 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms