Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cux2P70298 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cux2P70298 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux2P70298 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux2P70298 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms