Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf6P70279 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf6P70279 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Surf6P70279 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms