Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrig1P70193 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms