Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Traf5P70191 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf5P70191 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf5P70191 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms