Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc9P70170 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Abcc9P70170 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Abcc9P70170 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc9P70170 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms