Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabrb3P63080 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms