Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vamp3P63024 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms