Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps3P62908 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps3P62908 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms