Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Acta2P62737 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms