Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snrpd1P62315 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms