Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rps29P62274 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms