Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ufm1P61961 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ufm1P61961 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms