Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copz1P61924 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copz1P61924 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copz1P61924 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copz1P61924 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms