Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdk5r1P61809 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms