Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga11P61622 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga11P61622 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga11P61622 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms