Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah1aP61092 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah1aP61092 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms