Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snap25P60879 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snap25P60879 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms