Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NcstnP57716 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms