Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdcd5P56812 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms