Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TdgP56581 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TdgP56581 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TdgP56581 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TdgP56581 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TdgP56581 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TdgP56581 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TdgP56581 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms