Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gp1bbP56400 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms