Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtskP55097 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtskP55097 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtskP55097 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtskP55097 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms