Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PltpP55065 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PltpP55065 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PltpP55065 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PltpP55065 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms