Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GemP55041 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GemP55041 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GemP55041 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GemP55041 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GemP55041 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GemP55041 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GemP55041 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GemP55041 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms