Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efnb1P52795 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms