Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LumP51885 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LumP51885 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LumP51885 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LumP51885 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LumP51885 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LumP51885 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LumP51885 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LumP51885 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LumP51885 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LumP51885 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LumP51885 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LumP51885 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LumP51885 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LumP51885 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LumP51885 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LumP51885 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms