Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn1swP51491 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms