Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SftpdP50404 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SftpdP50404 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SftpdP50404 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms