Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc13P50207 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc13P50207 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms