Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp9P49962 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Srp9P49962 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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