Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Tmod1P49813 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Tmod1P49813 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Tmod1P49813 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmod1P49813 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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