Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdk5P49615 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdk5P49615 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms