Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnni3P48787 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnni3P48787 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms