Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl5P47962 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms