Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NodalP43021 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NodalP43021 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NodalP43021 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NodalP43021 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NodalP43021 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NodalP43021 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NodalP43021 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms