Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LtbP41155 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LtbP41155 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtbP41155 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtbP41155 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtbP41155 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms