Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox6P40645 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox6P40645 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox6P40645 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms