Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ThpoP40226 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms