Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprkP35822 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtprkP35822 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PtprkP35822 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PtprkP35822 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms