Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptpn1P35821 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms