Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab17P35292 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab17P35292 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab17P35292 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms